Stefan Donner studierte Orgel, Cembalo und Klavier an der Wiener Musikuniversität. Diese Studien schloss er jeweils mit Auszeichnung ab. Stipendien ermöglichten ihm weitere Studien in Amsterdam, Bayreuth und New York. Zahlreiche Konzertreisen führten ihn bereits durch ganz Europa, in die Türkei, nach Israel und die USA bis nach Australien. Zwischen 2020 und 2021 war Donner als Organist am Stift Klosterneuburg tätig. Derzeit unterrichtet er Orgel und Klavier an den Musikschulen Perchtoldsdorf und Meidling nahe Wien und ist dort zudem als Korrepetitor beschäftigt.

Musik von Bach, Mendelssohn und Dupré